Планшет подскажет выбор антибиотика

Авторы инновационной программы – ученые из Оксфордского университета. Mykrobe Software (Дословно: «Микробное программное обеспечение») использует данные библиотеки геномов патогенных бактерий, которая была собрана учеными из разных стран в течение последних десятков лет. Алгоритм поиска этих вариантов был реализован в программе, получившей название Mykrobe Predictor –» предсказатель микробов».

Чтобы Mykrobe Software смогла предсказать устойчивость к антибиотикам, в нее необходимо предварительно загрузить информацию о геномной последовательность бактерии, выделенной, например, в больнице. Спустя пару минут программа выдает, к каким антибиотикам микроорганизм устойчив, а к каким – чувствителен. Mykrobe Software может работать на обычном ноутбуке или планшете, что весьма удобно для применения на практике: новинку могут использовать клинические фармацевты и врачи непосредственно в «полевых» условиях.

Mykrobe Software уже прошла первую стадию испытаний, для которых ученые выбрали два вида патогенных бактерий: золотистый стафилококк (Staphylococcus aureus) и микобактерию туберкулеза (Mycobacterium tuberculosis). Исследователи использовали данные об известных вариантах генов этих видов, которые дают бактериям устойчивость к разным видам антибиотиков. Точность «предсказаний» оказалась довольно высокой. Относительно резистентности золотистого стафилококка программа правильно предсказывала в 99,1% случаев, для микобактерии туберкулеза эта цифра составила 82,6%. Более низкую точность во втором случае авторы связывают с белыми пятнами в изучении генетических механизмов развития устойчивости у Mycobacterium tuberculosis.

В настоящее время уникальное программное обеспечение проходит дальнейшие испытания, проводящиеся в трех британских больницах в рамках обширной программы, направленной на борьбу с госпитальными инфекциями. Если результаты этих испытаний окажутся не менее успешными, секвенирование бактериального генома станет рутинной процедурой в клинической практике. Потенциал этой процедуры был известен и ранее, однако его внедрение тормозило отсутствие необходимой технической поддержки, в частности, функционального программного обеспечения.

zdravoe.com

Хочешь узнать больше - читай отзывы